MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 6827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_013740	ATAG	2	8	498990	498997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013740	A	6	6	498998	499003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013740	GAA	2	6	499043	499048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013740	AGGA	2	8	499072	499079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013740	AGATGG	2	12	499154	499165	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013740	CCG	2	6	500411	500416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_013740	TAA	2	6	500482	500487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013740	AT	3	6	501521	501526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013740	GCA	2	6	501801	501806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_013740	GT	3	6	505796	505801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013740	AATA	2	8	505805	505812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013740	CAA	2	6	506882	506887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013740	GGA	2	6	506888	506893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013740	AT	3	6	509273	509278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013740	CCT	2	6	510187	510192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_013740	TAT	2	6	510204	510209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013740	TTC	2	6	510220	510225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013740	A	6	6	510228	510233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013740	GCA	2	6	511339	511344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013740	A	6	6	511364	511369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013740	AGGAA	2	10	511384	511393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013740	CAG	2	6	513464	513469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013740	TGC	2	6	513492	513497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013740	TAA	2	6	513525	513530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013740	AGG	2	6	513548	513553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013740	TCC	2	6	514401	514406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013740	GAA	2	6	514429	514434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013740	T	6	6	514839	514844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013740	AAGG	2	8	514875	514882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013740	AGG	2	6	515795	515800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013740	A	7	7	516264	516270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013740	TGC	2	6	516272	516277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013740	GCA	2	6	516282	516287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013740	T	7	7	516289	516295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013740	AAG	2	6	516299	516304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013740	AT	3	6	516329	516334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013740	AAGAA	2	10	516343	516352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1540	NC_013740	AGG	2	6	516843	516848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013740	CAC	2	6	517300	517305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_013740	GAA	2	6	517338	517343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013740	TTC	2	6	517357	517362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_013740	GGTT	2	8	518944	518951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013740	A	6	6	518953	518958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013740	TTTTA	2	10	518963	518972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013740	TTG	2	6	519010	519015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_013740	T	8	8	520643	520650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013740	A	6	6	521864	521869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013740	T	7	7	521930	521936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013740	AT	3	6	521980	521985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013740	GGAA	2	8	522110	522117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013740	TTG	2	6	526203	526208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013740	CAG	2	6	526231	526236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013740	TGATA	2	10	526240	526249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013740	A	6	6	526256	526261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_013740	TAT	2	6	526949	526954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1564	NC_013740	CA	3	6	527090	527095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_013740	ACA	2	6	527223	527228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013740	T	7	7	527359	527365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_013740	GAAAA	2	10	527485	527494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013740	AGAA	2	8	527514	527521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013740	G	6	6	527572	527577	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013740	C	6	6	527587	527592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1584	NC_013740	T	6	6	530228	530233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013740	A	6	6	530276	530281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013740	A	7	7	530287	530293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_013740	GTT	2	6	535649	535654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013740	GGAC	2	8	535665	535672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1599	NC_013740	TGC	2	6	535716	535721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_013740	GTA	2	6	535830	535835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1606	NC_013740	A	6	6	538010	538015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013740	T	6	6	538026	538031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013740	AC	3	6	538064	538069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_013740	A	7	7	539022	539028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013740	AGC	2	6	539041	539046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013740	T	6	6	539051	539056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013740	CCT	2	6	539273	539278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_013740	TATC	2	8	541492	541499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_013740	G	7	7	543738	543744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013740	TG	3	6	543747	543752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013740	CA	3	6	543760	543765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_013740	T	8	8	543772	543779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013740	CTG	2	6	543874	543879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013740	GGCG	2	8	543884	543891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_013740	TGC	3	9	544913	544921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013740	AGC	2	6	544928	544933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013740	GAAT	2	8	544970	544977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013740	T	6	6	544992	544997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013740	T	7	7	545016	545022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013740	TGC	2	6	547025	547030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013740	GCA	2	6	547040	547045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1628	NC_013740	AGG	2	6	548529	548534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013740	AGG	2	6	550744	550749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013740	GGT	2	6	551271	551276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013740	GAG	2	6	553065	553070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013740	T	6	6	553457	553462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013740	TTG	2	6	553464	553469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013740	G	8	8	554028	554035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013740	T	8	8	554060	554067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013740	T	6	6	554102	554107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_013740	CAG	2	6	555999	556004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1911	NC_013740	CG	4	8	641453	641460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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